一篇完整的 SCI论文应该包含 title，abstract，keywords，text，acknowledgement，references，有图和表的还应该包括legends。下面笔者来谈谈每项所包含的一些具体内容：
1.标题（title）
医学论文题目要求命题既能概括全文内容，又能引人注目，便于记忆和引用，做到恰当、确切、简短、鲜明，起到一种画龙点睛的作用，以引起读（编）者的注意与兴趣。
通常标题所在页叫标题页（title page），一般由以下几个部分组成：
（1）完整标题（full title）。
（2）小标题或眉题（running title/running head）：有些期刊不需要填写这一项。
（3）作者署名（author name）：医学论文署名要用真名而不用笔名。署名不可过多，应本着实事求是的原则，必须参加全部或部分主要工作，或参加文章撰写，对文章内容负责的人。署名次序应按贡献大小依次排列。
（4）作者单位（author affiliation）。
（5）通讯作者及其单位、邮箱、电话、传真等（corresponding author）。
有的期刊可能要求在标题页写出摘要字数，正文字数，或插图和表格数量，或标明是否有基金资助，是否存在利益冲突，等等。
2.摘要（abstract）
摘要是正文的高度浓缩，是医学论文内容的简短陈述，便于读者了解全文的要点，便于做文摘和检索。因此，摘要应力求简明扼要，字数一般为150～300字左右，如是特殊情况字数可以略多。摘要可以独立使用，不过简亦不过繁，不要一般的套话空话。
摘要最常见的为一段式或结构式两种，结构式摘要（structured abstract）一般从以下四个方面入手：
（1）背景或目的（background/objective）；
（2）方法（methods）；
（3）结果（results）；
（4）结论（conclusions）。
有的期刊要求列出关键词（keywords），是为了文献标引工作，即选出3～5个代表论文主要内容的单词或术语。医学论文关键词的选用应尽可能的用《医学主题词表》中的术语。讲座、综述、病案讨论、误诊教训、临床报道可以不使用。摘要和关键词单独列一页。
有的期刊要求撰写研究重点（research highlights），即文章结果的缩略内容，用最简短的语言阐述文章的意义及创新点。一般要求3～5句，每句不超过85个字符，包括空格。
3.正文（text）
医学论文由前言（引言）、临床资料（资料与方法）、结果和讨论等部分组成。各部分应妥善安排，既明确分工，避免重复，又互相配合，防止遗漏。我们将其分为前言、临床资料（资料与方法）、结果和讨论四个层次，也即为四个段式的格式。相当一部分医学论文都有参考文献，其附在全文结束后，顺序应以右上角码的形式标注在文内相印处（即引用文献处）。
正文主要包含以下几个部分：
（1）引言（introduction）：
引言部分是介绍课题背景，总结前人研究成果、现实情况及存在问题，并适当的强调本研究中最重要的发现或创新。
（2）材料与方法（materials and methods）：
这是 SCI论文写作的执行科研的关键之处，对于要进行的研究工作，必须按照实际情况，在事先选择好适合一定条件、数量的研究对象采用的特定实验、诊断或治疗方法（包括实验步骤、方法、器材试剂、药品），经过一定时期的观察，相同条件下的对照组，与他人结果比较并综合分析。
（3）结果（results）：
将原始资料全部集中起来，随机、客观地加以分析，不用特意地加以挑选。对于一些阴性结果，不必全部列出。尽量组织严密，符合逻辑、进行对比观察，在检验过程中对不一样的地方加以修正、补充。SCI论文写作在结论的问题中避免以假设来证明假设，以未知来说明未知，并依次循环推论。
（4）讨论与结论（discussion and conclusions）：
这部分是 SCI论文写作的精髓，主要是对研究结果的解释和分析。概述实验条件的优缺点，该研究结果与其他学者结果的异同，突出新发现、新发明；说明急需研究的方向和存在的主要问题以及研究局限性对结果的影响。
4.致谢（acknowledgements）
主要分为两个：第一是表明研究的基金来源，比如Nature Science Foundation of China（NSFC，国家自然科学基金），National Institute of Health（NIH，美国国家卫生研究院）。写基金时一般要标注清楚基金号码（Grant Number），只有这样才算是该项基金的研究成果，也可以算作实验室的研究成果。第二是对参与人员（没有列在作者中的研究人员）和单位表示感谢，前提是须得到被致谢者的同意。
5.利益冲突（conflict of interest statement）
在致谢后需要附带一个利益冲突声明，这是一种“行规”，为了表明其发表文章、言论的客观立场。倘若无利益冲突，就写：We declare that we have no conflict of interest或The authors do not have any possible conflicts of interest；倘若确实存在利益冲突，则写：We have the following conflicts：……
6.参考文献（references）
医学论文都有参考文献，其附在全文结束后，顺序应标注在文内相应处（即引用文献处）。
所列参考文献的目的，在于引证资料（观点、方法等）的来源，不可随意转抄。一般要求引用文献者必须用阅读过的重要的、近年的文献为准。参考文献重要在于格式。不同杂志对参考文献格式要求不一样，具体下来有所区别的可以分为：作者的写法，有的是简写在前，有的简写在后，有的简写有点，有的简写没有点；文章的名字，有的要加上引号，有的没有引号；期刊的写
法，有的要简写，有的要全称，有的要斜体，有的则不需要；年和卷期号的顺序，有的是年在前，有的是年在后；文献的排列顺序，有的是按照字母的顺序，有的则是按照在论文中出现的顺序用阿拉伯数字排序。这些问题，看来很是琐碎，但是如果你的参考文献排列的乱七八糟，那就会使得评审人对你论文的印象很差，认为你没有认真组织和撰写论文，造成一定的负面影响。
关于如何有效引用文献？我在这里要强调下：作者最好在文献列表里引用自己的两三篇高水平论文，最好是发在影响因子较高的期刊上。在互联网如此发达的今天，编辑很可能会检索一下论文的通讯作者或第一作者。也就是说，提高自己在互联网上的知名度是很有必要的。
有关参考文献的整理和管理，请读者参见本书的相关章节。
7.图例（figure legends）
若研究结果中含有图片，在论文的最后要注明图例。图例的写作应严格按照期刊要求，如有的期刊要求另页双行打印，位置在表格或参考文献后面。图例包含图序，图题和图注。图序即插图的序号：根据插图在正文中被提及的顺序，用阿拉伯数字进行排序，如Figure 1、Figure 2等，并尽量把图安排在靠近第一次提及它的位置。即使只有一个图片，也要有图序。图题即插图的标题，要求简明准确，要有较好的说明性和专指性，不要为了追求形式上的简洁而选用过于泛指的图题。图中未能表达又必须表达的信息应在图注中说明。如图中含有误差线，则应阐述是标准误、标准差、信度边界或数值范围。如在图中标注了显著性值，则应在图注中说明。当插图中含箭头、数字、符号或字母时，则要在相应的位置做明确的说明。
8.表格（table）
表格的位置在参考文献或图例后面，或是放在正文中与之一起上传，或单独放在word里上传。表格包含表序，标题以及必要的表注。表序和图序一样，根据在正文中被提及的顺序，用阿拉伯数字进行标注，表题是表格的重要组成部分，是对表中内容的概括，表题应主谓有序，简洁、准确。表注是对表中有关内容的必要补充和说明，应简明扼要。
9.插图（figure）
插图有两种类型，一是线条图（包括坐标图），二是照片图。线条图应线条清晰，粗细均匀，比例适当；照片图应图像清晰，层次分明，反差适度。插图一般以TIFF或JPEG的形式单独上传，有些期刊也允许把图片放在PowerPoint（PPT）里上传，或是放在文章的最后直接上传。插图单独上传时图片中不能包含图例。
10.补充材料（supplementary material）
SCI论文篇幅是有限制的，对于不十分重要的数据，可放入到补充材料（supplementary material）中。补充材料可以是文字、图、表或是视频片段等，它是一些支持论文内容，而又不能写入正文的材料或数据。它将有助于审稿人理解正文内容，并且发表后跟正文一起放在网上供大家点击查看，而不会被印刷在杂志中。补充的文字或表格和图在上传的时候有专门的选项，可以单独上传。图例或表例直接放在supplementary里和图表一起上传就行。
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